dread gap ; match .

'This is the initial data matrix assembled for the Zoologica Scripta manuscript Preliminary Molecular Phylogeny for Mecoptera and Siphonaptera.  
All of the taxa include all gene regions except for Caurinus and some outgroups

Consists of 18s (0-2136) 28s (2137 -8601) ef1 (8602-9693) and coii (9694-10292) and 117 morph characters (10293-10409)
The morphological matrix was not included for the Zoologica Scripta Manuscript
The ccodes at the end of the matrix specify whether a gene is to be included or excluded
The regions that are blocked are those that are blocked out in the alignment, and are included for the entire alignment and excluded for the conserved alignment
the variable regions can be included or excluded
and the codon weighting scheme is specified

'

10410 69
Oecetis                      ????????????????????????????TGCAAGTCTAAGTAAAAGCCGAATTA??AGGTGAAACCGCGAATGGCTCAATATATCAGTTTTGGTTCCTTAGATCGTACACA??GTTACTTGGATAACTGTGGCAATTCTAGAGCTAATACATGCAA????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GATCGCATGGTCCAGCACCGGCGACGCATCTTTCAAATGTCTGCCTTATCAACTGTCGATGGTAGTTTATGCGACTACCATGGTTGTCACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCACGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCCGGCACGGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACGATACGGGACTC?GTCCGAGGCCTCGTGATCGGAATGATTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCATATACTAAAGTTGTTGCGGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAAATTGTG???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCGGGCTAACACAC??GCCTGAATATTGTACGCATGGAATAATAGAATAGGACCTCGGTTCTGTTTT??GTTGGCTTTCT?GA?TACC?A?GAGGTAATGATTAATAGGGACAACTGGGGGCATTCGTATTGCGACGTTAGAGGTGAAATTCTTGGATCGTCGCAAGACGGACTAAAGCGAAAGCATTTGCCAAAGGTGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTAGAGGTTCGAAGGCGATTAGATACCGCTGTAGTTCTAACCATAAATGATGCCAGCCAGCGATCCGCCGAAGTTTCTAATCTTAACCCGGTGGACAGCTCCCGGGAAACCAAAGCTTTCGGGCTCCGGGGGGAGTATGGTTGCAAAGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTCGACTCAACACGGGAAAACTCACCAGGCCCGGACACTGGAAGGATTGACGGATTAACAGCTCTTTCTCGATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGCTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCAGGTTAATTCCGGTAACGAACGTAACTCTAG???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GAGATTGAGCAATAGCAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTCCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGGGATCAGCGTGTCCTCCTTG?GCCTAACGGCCCGGGTAACCCGATG?AAACCCCTTCGTGATAGGGATTGGGGTTTGCAATTCTCCCCCATGAACGAGGAATTCCTAGTAAAAGCGGGTCACCAGCTCGCGTTGATTGCGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATGGA?TGATTTGGTGAGGTCTTCGGACTG?????????????????????????????????????????????????????TTTGATCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTTTCC??GCGAGGAGAGAAACTAACGAGGATTCCCCGAGTAGCGGCGAGCGAAACGGGAAG?AGCCCAGCGCTGAATCCCGCCGTCCGCGCGGACGGCCGGGAAATGTAGCGTTCGGTAGGAGAGTTAAACACAAACGCGCGGTCATTAGTCACGATCGCCAGTCCAAGTTCATCTTGAACGGGGCC?GTTTACCCGCAGAGGGTGCCAGGCCCGTGGAGACGGTGGTCGGCCG?CGACGGTCTCCCTACCA?AGAGTCGGGTTGCTTGAGAGTGCAGCCCTAAGTGGGTGGTAAACTCCATCTAAGGCTAAATATCACCACGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGAACTTTGAAGAGAGAGTTAAAGAGTACGTGAAACCGTTCAGGGGTAAACCCGTGGAACTCGAACGAG?CGAACGGGGAGATTCAT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GTGCACTTCTCCC?TCAGTATAACACCGCGACCCGTCGCGCTGCCGTCG??AACGCTCCGTGC???GGTCGTCCC??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA?CCCCAAAAAAA?????????????????????????????????????????????????????????????????
Pycnopsyche                  TCATATGCTTGTCTCAAAGACTAAGCCATGCAAGTCTCAGTAAAAGCCGAATTA??AGGTGAAACCGCGAATGGCTCAATATATCAGTTTTGGTTCCTTAGATCGTACAC??GGTTACTTGGATAACTGTGGCAATTCTAGAGCTAATACATGCAA????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GATCGCACGGTCTAGCACCGGCGACGCATCTTTCAAATGTCTGCCTTATCAACTGTCGATGGTAGTTTATGCGACTACCATGGTTGTCACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCACGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCCGGCACGGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACGATACGGGACTC?GTCCGAGGCCTCGTGATCGGAATGATTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCATATACTAAAGTTGTTGCGGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAAATTGTG???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCGGGCTAACACT??TGCCTGAATATTGTACGCATGGAATAATAGAATAGGACCTCGGTTCTGTTTT??GTTGGCTTTCT?GA?TACC?A?GAGGTAATGATTAATAGGGACGACTGGGGGCATTCGTATTGAGACGTTAGAGGTGAAATTATTGGATCGTCGCAAGACGGACTAAAGCGAAAGCATTTGCCAAAGGTGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTAGAGGTTCGAAGGCGATTAGATACCGCTGTAGTTCTAACCATAAATGATGCCAGCCAGCGATCCGCCGAAGTTTCTAATTTTAACCCGGTGGGCAGCTCCCGGGAAACCAAAGCTTTCGGGCTCCGGGGGGAGTATGGTTGCAAAGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTCGACTCAACACGGGAAAACTCACCAGGCCCGGACACTGGAAGGATTGACGGATTAACAGCTCTTTCTCGATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGCTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCAGGTTAATTCCGGTAACGAACGTAACTCTAG???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GAGATTGAGCAATAGCAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTCCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGGGATCAGCGTGTCCTCCTTG?GCCTAACGGCCCGGGTAACCCGATG?AAACCCCTTCGTGATAGGGATTGGGGTTTGCAATTCTCCCCCATGAACGAGGAATTCCTAGTAAAAGCGAGTCACCAGCTCGCGTTGATTGCGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATGGA?TGATTTGGTGAGGTCTTCGGACTG?????????????????????????????????????????????????????TTTGATCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTTTCCACGGAGGAAAAGAAACTAACGAGGATTCCCCGAGTAGCGGCGAGCGAAACGGGAAG?AGCCCAGCGCTGAATCCTGCGGCCCCGGCGGGCCGCCGGGAAATGTAGCGTTCGGGAGGAGAGTTATACATACACGCGCGGTCATTAGTCACGGCTGCCTGTCCAAGTTCATCTTGAACGGGGCCCGCTTACCCGCAGAGGGTGCCAGGCCCGTGGTGACGGTAGCCGGCCG?CGACGGTCTCTCTCCCT?AGAGTCGGGTTGCTTGAGAGTGCAGCCCTAAGTGGGTGGTAAACTCCATCTAAGGCTAAATACTACCACGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGAACTTTGAAGAGAGAGTTAAAGAGTACGTGAAACCGTTCAGGGGTAAACCTGTGGAACTCAAACGAG?CGAACGGGGAGATTCAT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GTGCACTTCTCCC?TTAGTATAACACCGCGACCCGTCGCGCCGCGGTCG??AATGCGCCGTGC???GGTTGACCC??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA?CCCCAAAAAAA?????????????????????????????????????????????????????????????????
Limniphilus                  TCATATGCTTGTCTCAAAGACTAAGCCATGCAAGTCTCAGTAAAAGCCGAATTA??AGGTGAAACCGCGAATGGCTCAATATATCAGTTTTGGTTCCTTAGATCGTACACA??GTTACTTGGATAACTGTGGCAATTCTAGAGCTAATACATGCAA????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GATCGCACGGTCTAGCACCGGCGACGCATCTTTCAAATGTCTGCCTTATCAACTGTCGATGGTAGTTTATGCGACTACCATGGTTGTCACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCACGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCCGGCACGGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACGATACGGGACTC?GTCCGAGGCCTCGTGATCGGAATGATTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAGTTGTTGCGGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAAATTGTG???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ACTTTGAACAAATTAGAGTGCTCAAAGCGGGCTAACACT??TGCCTGAATATTGTACGCATGGAATAATAGAATAGGACCTCGGTTCTGTTTT??GTTGGCTTTCT?GA?TACC?A?GAGGTAATGATTAATAGGGACAACTGGGGGCATTCGTATTGCGACGTTAGAGGTGAAATTCTTGGATCGTCGCAAGACGGACTAAAGCGAAAGCATTTGCCAAAGGTGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTAGAGGTTCGAAGGCGATTAGATACCGCTGTAGTTCTAACCATAAATGATGCCAGCCAGCGATCCGCCGAAGTTTCTAATTTTAACCCGGTGGGCAGCTCCCGGGAAACCAAAGCTTTCGGGCTCCGGGGGGAGTATGGTTGCAAAGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTCGACTCAACACGGGAAAACTCACCAGGCCCGGACACTGGAAGGATTGACGGATTAACAGCTCTTTCTCGATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGCTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCAGGTTAATTCCGGTAACGAACGTAACTCAAG???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GAGATTGAGCAATAGCAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTCCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGGGATCAGCGTGTCCTCCTTG?GCCTAACGGCCCGGGTAACCCGATG?AAACCCCTTCGTGATAGGGATTGGGGTTTGCAATTCTCCCCCATGAACGAGGAATTCCTAGTAAAAGCGAGTCACCAGCTCGCGTTGATTGCGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATGGA?TGATTTGGTGAGGTCTTCGGACTG?????????????????????????????????????????????????????TTTGATCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTTTCCGCGGAGGAAAAGAAACTAACGAGGATTCCCCGAGTAGCGGCGAGCGAAACGGGAAG?AGCCCAGCGCTGAATCCTGCGGCCCCGGCGGGCCGCCGGGAAATGTAGCGTTAGGGAGGAGAGTAATATATACACGCGCGGTCATTAGTCACGGCTGCCTGTCCAAGTTCATCTTGAACGGGGCCCGCTTACCCGCAGAGGGTGCCAGGCCCGTGGTGACGGTAGCCGGCCG?CGACGGTCTCTCTCCCC?AGAGTCGGGTTGCTTGAGAGTGCAGCCCTAAGTGGGTGGTAAACTCCATCTAAGGCTAAATACTACCACGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGAACTTTGAAGAGAGAGTTAAAGAGTACGTGAAACCGTTCAGGGGTAAACCTGTGGAACTCAAACGAG?CGAACGGGGAGATTCAT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GTGCACTTCTCCC?TTAGTATAACACCGCGACCCGTCGCGCCCCGGTCG??AATGCGCCGTGC???GGTTGACCC??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????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Tanyptera                    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Epiphragma                   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Apteronpanorpa               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Apterobittacus               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B._punctiger                 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Harpobittacus                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B._selysi                    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B._walkeri                   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B._pillicornis               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Hylobittacus                 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B._coloradensis              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B._californicus              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Malaraeus_sinomus            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Thrassis_bacchi_gladiolus    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Ceratophyllus_petrochelidoni 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Megabothris                  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Chorista                     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Coptopsylla                  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Catallagia                   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Stenoponia_americanus        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Hystrichopsylla_talpae       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Merope_1                     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N._neotropica                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N._dipteroides               TCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTCAGTGCAAGCCACATTA??AGGTGAAACCGCGAATGGCTCATTACATCAGTTATGGTTCCTTAGATCGTACCCACA?TTACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCAAACAGAGTTCCGA?CTAGAGATGGAAGGAATGCTTTTATTAGATC?AAAACCAATCGGTGGC?GGGCTT?GCTC?GCTCA?????????CCGT?TTGACTTGGTGACTCTGAATAACTTTGGGCTGATCGCACGGTCTTGTACCGGCGACGCATCTTTCAAATGTCTGCCTTATCAACTGTCGATGGTAGTTTCTGCGACTACCATGGTTGTTACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCACTCCCGGCACGGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACGATACGGGACTC?ATCCGAGGCCCCGTAATCGGAATGAGTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCGGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAATCTGTGTCCCATGCTGTCGGTTCACCGCTCGCGGTGTTCAACTGGCAAGCC??GTGGGACGTCCTACCGGT?GGG??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CTTAGCCCGTCAAAAGGCGG??CCCAA?CTCAAAATCCTACCGCGGT?GCTCTTAACCGAGTGTCGAGGTGGGCCGGTACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTTAAAGCAGGCTAAATTTC??GCCTGAATACTGTGTGCATGGAATAATGGAATAGGACCTCGGTTCTATTTT??GTTGGTTTTCG?GA?ACCC?C?GAGGTAATGATTAATAGGGACAATTGGGGGCATTCGTATTGCGACGTTAGAGGTGAAATTCTTGGATCGTCGCAAGACGGACAGAAGCGAAAGCATTTGCCAAACGTGTTTTCATCAATCAAGAACGAAAGTTAGAGGTTCGAAGGCGATCAGATACCGCCCTAGTTCTAACCATAAACGATGCCAGCTAGCGATCCGCCGAAGTTCCTCCGAT?GACTCGGCGGGCAGCTTCCGGGAAACCAAAGCTTTTGGGTTCCGGGGGAAGTATGGTTGCAAAGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAACCTCACCAGGCCCGGACACCGGAAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCGGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGACTCTAGCCTGCTAACTAGGCGTACTTTCCGGTATCTCGATGGCTCGCCGGCT???????????????????????????????????????????????TGGCTTCGGCCTC?GTCGTGT???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GTGGTTTTCACTACCGGCGTACA????AACAATTCTTCTTAGAGGGACAGGCGACA???TTTAGTCGCACGAGATTGAGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGGGATCAGCGTGTCTTCCCTG?GCCGAAAGGTCCGGGTAACCCGTTG?AACCCCCTTCGTGCTAGGGATTGGGGCTTGCAATTGTTCCCCATGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCGAGTCATAAGCTCGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGATTTAGTGAGGTCTTCGGACCGGTACGCGGCAGCGTT???TCGACATTGCCGATGTTGCTGGGAAGATGACCAAACTTGATTATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTTTCC?????????????AACTAACTAGGATTCCCTTAGTAGCGGCGAGCGAACAGGGAAAA?GCCCAGCACTGAATCCCGAGGCCGGCACCGGTCTCTGGGAAATGTAGTGTTAGGGAGG?????????????ATCCATCATCCC?GAGATAACGTGGCGCGTTCAAGTCCATCTTGAATGGGGCC?ATTTACCCGTAGAGGGTGCCAGGCCCGTATGACCATCACGTGTTTC??GGGAGGATCTCTCCTC?AGAGTCGGGTTGCTTGAGAGTGCAGCTCTAAGTGGGTGGTAAACTCCATCTAAGGCTAAATATGACCACTAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGAACTTTGAAGAGAGAGTTCAAGAGTACGTGAAACCGTTCAGGGGTAAACCTGAGAAACCCGAAAGAT?CGAAAGGGGAGATTCAG????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CGCTCTCGTTGTGTCGCCGTCTCTTCGGGGCTCGATGTCAGGGATCCGTCTCTGTCACGACCCCGTCGGACTGTGCGGCCGCGAGTGC??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GTGCACTTCTCCC?CTAGTAGGACGTCGCGACCCGTTGGGTGTCGGTCT??ACGGCCC?GCGC???GC?TAGCCT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GTCACGGTCTTCGGACCGGGGCAGAGCCGCGGTGTTCCCGGCCGACTGCCCGACGGTATAAAAGGCACTGGGCCGCATTCACGTGCGTCCTGACCCCCCGCAAAGTGTGGCGATTACTGGACGTCGAGCCTGGCTCGGCCCCGGTACCGCCCGCTTGTTGGCGGGGGTGTTCTCGGACAGACCCTCTTGCCCGTCG?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????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P._fluvicaudaria             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P._cognata                   TCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTCAGTGCAAGCCACATTA??AGGTGAAACCGCGAATGGCTCATTACATCAGTTATGGTTCCTTAGATCGTACCCACATTTACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCAAATAGAGTTCCAA?CCAGAGATGGAAGGAATGCTTTTATTAGATC?AAAACCAATCGGTAGC?GGGCTT?GCCTTGCATA?????????CCGT?TTGATTTGGTGACTCTGAATAACTTTGGGCTGATCGTACGGTCTCGTACCGACGACGCATCTTTCAAATGTCTGCCTTATCAACTGTCGATGGTAGTTTCTGCGACTACCATGGTCGTTACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCACTCTCGGCACGAGGAGGTAGTGACGAAAAATAACGATACGGGACTC?ATCCGAGGCCCCGTAATCGGAATGAGTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCGGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAATTTGTGTCCCATACTGTCGGTTCACCGCTCGCGGTGTTTAACTGGCATGAT??ATGGGACGTCCTATCGGT?GGG???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TTAGCCCGTAAAAAGGCAA??CCCAA?CTCAAAATCTCATCACGGT?GCTCTTAAACGAGTGTCGAGGTGGGCCGATACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTTAAAGCAGGCTAAATTTT??GCCTAAATATTGTGTGCATGGAATAATAGAATAGGACCTCGTTTCTATTTT??GTTGGTTTTCG?GA?ATTC?C?GAGGTAATGATTAATAGGGACAACTGGGGGCATTCGTATTGCGACGTTAGAGGTGAAATTCTTGGATCGTCGCAAGACGGACAGAAGCGAAAGCATTTGCCAAATGTGTTTTCATCAATCAAGAACGAAAGTTAGAGGTTCGAAGGCGATCAGATACCGCCCTAGTTCTAACCATAAACGATGCCAGCTAGCGATCCGCCAAAGTTCCTCCGAT?GACTTGGCGGGCAGCTTCCGGGAAACCAAAGCTTTTGGGTTCCGGGGGAAGTATGGTTGCAAAGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAACCTCACCAGGCCCGGACACTGGAAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCAGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGACTCTAGCCTGCTAAATAGGCGTA?TTTCCAGTATCTCGAAGGCTCGGCTTCT???????????????????????????????????????????????TGACTTCGGTCTTGATGGTC????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGAGTTTTTACTACTGGCGTACA????AACAATTCTTCTTAGAGGGACAGGCGACA???TTTAGTCGCACGAGATTGAGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAAGGAATCAGCGTGTCCTCCCTA?TCCGAAAGGAACGGGTAACCCGTTG?AACCTCCTTCGTGCTAGGGATTGGGGCTTGCAATTGTTCCCCATGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCGAGTCATAAGCTCGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGATTTAGTGAGGTCTTCGGACCGGTACGCGGCAATGTT???TCGGCATTGCTGATGTTGCTGGGAAGATGACCAAACTTGATTATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTTTCCGCGGAGGAAAAGAAACTAACTAGGATTCCCTTAGTAGCGGCGAGCGAACAGGGAAAA?GCCCAGCACTGAATCCCCTAGCCGATTTCGGATAGTGGGAAATGTAGTGTATAGGAGG?????????????ATTCATTTATCCTGAGATCATGTAGCGCGTTTAAGTCCATCTTGAATGGGGCC?AATTACCCATAGAGGGTGCCAGGCCCGTAAAACTGTTACTGATTTC??GGGAGGATCTCTCCTT?TGAGTCGGGTTGCTTGAGAGTGCAGCTCTAAGTGGGTGGTAAACTCCATCTAAGGCTAAATATAACCACGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGAACTTTGAAGAGAGAGTTCAAGAGTACGTGAAACCGTTCAGGGGTAAACCTGAGAAACCCGAAAGTT?CGAATGAGAAGATTCAG????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TATCTTAC?ATTAGGTCGAGCATAG?CATTTTT?GTGATGATATTTAATATGACTT?CGGTTATTTTTAATGTTACACTGAATTTG?TTAT?GATAACTTGGCTATGGAGGT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATGCACTTCTTCT?CTAGTAGGACGTTGCAACTCATTGGATGTTAATCT??AAGGTCC?CTTATT?GG?TAGCCT???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AATTTATATATATTTCGGTATATGTGATTTAGACCATAGGTG?CTTACCTGATTA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Neopanorpa                   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P._carolinensis              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P._debilis                   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P._arakarae                  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P._claripennis               TCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTCAGTGCAAGCCACATTA??AGGTGAAACCGCGAATGGCTCATTACATCAGTTATGGTTCCTTAGATCGTACCCACATTTACTTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCAAATAGAGTTCCAA?CCAGAGATGGAAGGAATGCTTTTATTAGATC?AAAACCAATCGGTAGC?GGGCTT?GCCTTGCATA?????????CCGT?TTGATTTGGTGACTCTGAATAACTTTGGGCTGATCGTACGGTCTCGTACCGACGACGCATCTTTCAAATGTCTGCCTTATCAACTGTCGATGGTAGTTTCTGCGACTACCATGGTCGTTACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCACTCTCGGCACGAGGAGGTAGTGACGAAAAATAACGATACGGGACTC?ATCCGAGGCCCCGTAATCGGAATGAGTACACTTTAAATCCTTTAACGAGGATCAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCGGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAATTTGTGTCCCATACTGTCGGTTCACCGCTCGCGGTGTTTAACTGGCATGCT??GTGGGACGTCCTATCGGT?GGG???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TTCGCCCGTAAAAAGGCAA??CCCAA?CTCAAAATCTCATCACGGT?GCTCTTAAACGAGTGTCGAGGTGGGCCGATACGTTTACTTTGAACAAATTAGAGTGCTTAAAGCAGGCTAA?TCTC??GCCTGTATATTGTGTGCATGGAATAATAGAATAGGACCTCGTTTCTATTTT??GTTGGTTTTCG?GA?ATTC?C?GAGGTAATGATTAATAGGGACAACTGGGGGCATTCGTATTGCGACGTTAGAGGTGAAATTCTTGGATCGTCGCAAGACGGACAGAAGCGAAAGCATTTGCCAAATGTGTTTT